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Citrobacter sp.
Espèces répertoriées :
- Complexe Citrobacter freundii : C. freundii stricto sensu, C. braaki, C. gillenii, C. murliniae, C. rodentium, C. sedlakii, C. werkmanii, C. youngae
- Citrobacter koseri
- Citrobacter farmeri
- Citrobacter amalonaticus
- Citrobacter pasteurii
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Classification :
- Proteobacteria
- Gammaproteobacteria
- Enterobacteriales
- Enterobacteriaceae
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Examen direct :
- Bacilles Gram négatif
- Coloration bipolaire
- État frais : mobilité (ciliature péritriche)
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Culture :
- Morphologie :
- Grosses colonies rondes et lisses, à bords réguliers
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Habitat naturel :
- Flore commensale digestive de l’homme et des animaux (mammifères, oiseaux)
- Environnement (plantes, sol, eaux)
- Aliments
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Facteurs de virulence :
- Peu étudiés.
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Épidémiologie :
- Origine majoritairement nosocomiale
- Bactéries opportunistes
- Résistance des souches en augmentation
- Méningites néonatales à Citrobacter koseri : mortalité importante, 75% de séquelles neurologiques
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Pathogénicité :
- Infections urinaires
- Infections gastro-intestinales (diarrhées, péritonites)
- Infections respiratoires
- Infections cutanéomuqueuses
- Bactériémies
- Méningites néonatales (C. koseri), complication = abcès cérébral
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Prélèvement :
- Urines
- Sang pour hémocultures
- Selles
- Liquides de ponction
- Suppurations diverses
- Prélèvement vaginal
- Prélèvements respiratoires
Réalisation de l'examen direct
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Mise en culture :
- Bactéries non exigeantes
- Respiration : aéro-anaérobie facultative
- Milieux : milieux usuels, milieux chromogènes
- Incubation : 37°C, air ambiant
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Identification :
- Caractéristiques biochimiques d'orientation :
- Catalase positive
- Oxydase négative
- MALDI-TOF couplé à la spectrométrie de masse (attention confusion entre les espèces proches)
- Galeries d'identification bactérienne
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Résistances naturelles :
- C. koseri, C. farmeri, C. amalonaticus : groupe 2 des Entérobactéries (pénicillinase de bas niveau)
- C. freundii, autres Citrobacter : groupe 3 des Entérobactéries (céphalosporinase chromosomique, gène AmpC)
- Pénicillinases de haut niveau
- Céphalosporinases hyperproduites
- β-lactamases à spectre étendu
- Carbapénémases
Résistances acquises aux β-lactamines :
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Traitement curatif :
- Choix des molécules selon le site de l'infection et l'antibiogramme
- Citrobacter du groupe 3 des Entérobactéries : risque de sélection de mutants résistants en cas d'utilisation en monothérapie des céphalosporines de 3ème génération, risque très diminué avec le céfépime
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Prophylaxie :
- Contrôle de l'immunodépression
- Respect des mesures d'hygiène des mains
- Respect des bonnes pratiques d'hygiène hospitalière