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Empedobacter sp.
Espèces : Empedobacter brevis, Empedobacter falsenii, Empedobacter tilapiae
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Classification :
- Bacteroidota
- Flavobacteriia
- Flavobacteriales
- Weeksellaceae
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Examen direct :
- Bacilles Gram négatifs courts
- Absence de mobilité à l’état frais
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Culture :
- Morphologie :
- Colonies rondes, lisses et brillantes
- Certaines souches : colonies pigmentées en jaunes
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Habitat naturel :
- Environnement : eaux, sol
- Plantes
- Alimentation
- Environnement hospitalier
- Parasites de protistes
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Facteurs de virulence :
- Pas de facteurs de virulence particuliers liés au genre Empedobacter.
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Épidémiologie :
- Affections liés au soin en milieu hospitalier
- Facteurs de risque : port d’un matériel intraveineux (cathéter), immunodépression
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Pathogénicité :
- Rarement rencontré en pathologie humaine, pathogénicité limitée.
- Déjà décrit dans les pathologies suivantes :
- méningites
- endophtalmies
- bactériémies
- infections urinaires
- surinfections de plaies
- abcès
- pneumopathies
- infections chez les animaux (poissons, chiens)
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Prélèvement :
- Sang
- Prélèvements oculaires
- Suppurations
- Liquides de ponctions
- Urines
- Prélèvements respiratoires
Réalisation de l'examen direct
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Mise en culture :
- Bactéries non exigeantes
- Respiration : aérobie stricte
- Incubation : 30 à 37°C
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Identification :
- Caractéristiques biochimiques d'orientation :
- Catalase positive
- Oxydase positive
- MALDI-TOF couplé à la spectrométrie de masse
- Séquençage de l’ARN 16S
- Empedobacter falsenii :
- Résistances naturelles : ampicilline, ampicilline-sulbactam, céfalotine, méropénème, colistine
- Sensibilité variable : pipéracilline-tazobactam, céfotaxime, ceftazidime, imipénème, ciprofloxacine
- Sensibilité : céfépime, amikacine, gentamicine, triméthoprime-sulfaméthoxazole
- Empedobacter brevis : globalement plus sensible, sensibilité variable selon les antibiotiques
- Sensibilité : triméthoprime-sulfaméthoxazole, céfépime
- Résistance naturelle : méropénème
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Traitement curatif :
- Choix de la molécule selon le site de l’infection et l’antibiogramme.
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Prophylaxie :
- Pas de prophylaxie spécifique
- Précautions d’hygiène environnementale et hospitalière
Mise à jour : août 2023