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Escherichia coli

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    Classification :
  • Proteobacteria
  • Gammaproteobacteria
  • Enterobacteriales
  • Enterobacteriaceae
    Examen direct :
    • Bacilles Gram négatif
    • Coloration bipolaire
    • Asporulés
    • Capsule parfois visible
    • État frais : mobilité (ciliature péritriche)
    Culture :
    • Morphologie :
      • Colonies rondes à bords réguliers de 2mm de diamètre, plates en dos de scarabée ou variété muqueuse (due à la capsule – colonies muqueuses bombées)
    Habitat naturel :
  • Flore commensale digestive (colon +++) de l’Homme et des animaux
  • Espèce dominante de la flore intestinale aérobie
    Facteurs de virulence :
  • Protéines d’adhésion
  • Production de cytotoxines
  • Synthèse de protéases
  • Systèmes de captation du fer
  • Production d’entérotoxines (souches ECET) : entérotoxine thermolabile, entérotoxine thermostable
  • Production de shigatoxines ou vérotoxines (souches ECEH) : Stx1 et Stx2
    Épidémiologie :
  • Bactérie ubiquitaire

  • 1ère cause d’infections urinaires

  • 2ème cause de méningites néonatales

  • Diarrhée infantile dans les pays en voie de développement : mortalité importante

  • Syndrome Hémolytique et Urémique :
    • Touche préférentiellement les enfants < 15 ans
    • Sérotype le plus fréquemment impliqué : sérotype O157:H7
    • Réservoir : tube digestif des ruminants (bovins +++)
    • Contamination par consommation de viande rouge insuffisamment cuite, transmission interhumaine ou par contact direct avec les animaux
    Pathogénicité :
  • Infections intestinales :
    • ECEP (E. coli entéropathogènes) : diarrhées infantiles (pays en voie de développement) avec selles aqueuses et muqueuses + hyperthermie + vomissements
    • ECET (E. coli entérotoxinogènes) : diarrhées du voyage (turista), diarrhées infantiles +++ (pays en voie de développement) avec syndrome cholériforme (diarrhées liquidiennes aiguës + crampes abdominales + nausées)
    • ECEH (E. coli entérohémorragiques) :
      • Diarrhées aqueuses
      • Colites hémorragiques (2 à 10 jours)
      • Complications :
        • Syndrome Hémolytique et Urémique (SHU) avec anémie hémolytique + thrombopénie + insuffisance rénale aiguë (triade caractéristique)
        • Purpura Thrombotique Thrombopénique (PTT)
    • ECEI (E. coli entéroinvasifs) : diarrhées aqueuses ou syndrome dysentérique (hyperthermie + diarrhées sanglantes et purulentes)
    • ECEA g (E. coli entéroagrégatifs) : diarrhées aiguës ou persistantes (enfants et adultes)
    • ECEAgST (E. coli entéroagrégatifs producteurs de shigatoxine) : épidémies massives de diarrhées
    • ECAD (E. coli à adhésion diffuse) : diarrhées pédiatriques (enfants de 2 à 5 ans)

  • Pathologies intestinales chroniques :
    • Implication dans la forme iléale de la maladie de Crohn
    • Implication dans le cancer colorectal

  • Infections extra-intestinales :
    • Infections urinaires (cystites, pyélonéphrites)
    • Infections para-intestinales : appendicites, péritonites, cholécystites
    • Méningites néonatales
    • Bactériémies
    • Infections ostéo-articulaires
    Prélèvement :
    • Urines
    • Sang pour hémocultures
    • Liquides de ponction
    • Suppurations diverses
    • Liquide céphalorachidien
    • Selles

    Réalisation de l'examen direct
    Mise en culture :
    • Bactéries non exigeantes
    • Respiration : aéro-anaérobie facultative
    • Milieux : milieux usuels, milieux chromogènes
    • Incubation : 37°C, air ambiant
    Identification :
    • Caractéristiques antigéniques :
      • Typage des antigènes somatiques O = lipopolysaccharide de surface
      • Typage des antigènes H = protéines de flagelles
      • Typage des antigènes K = antigènes de surface (enveloppe ou capsule)
      • Typage des antigènes F = antigènes des systèmes d’adhésion (pili)
    • Caractéristiques biochimiques d'orientation :
      • Catalase positive
      • Oxydase négative
    • MALDI-TOF couplé à la spectrométrie de masse (attention confusion avec Shigella sp.)
    • Galeries d'identification bactérienne
    • PCR (identification, recherche des toxines)
    Résistances naturelles :
    • Groupe 1 des Entérobactéries : céphalosporinase de très bas niveau
    • Souche sauvage = souche multisensible aux antibiotiques utilisés contre les Gram négatif

    Résistances acquises aux β-lactamines :
    • Pénicillinases plasmidiques
    • Céphalosporinase hyperproduite
    • β-lactamases à spectre étendu
    • Carbapénémases
    Traitement curatif :
  • Syndrome Hémolytique et Urémique : pas de traitement antibiotique, traitement symptomatique

  • Diarrhées aiguës : traitement symptomatique, antibiothérapie uniquement si forme sévère

  • Méningites : association d’une β-lactamine + aminoside ou fluoroquinolone

  • Infections urinaires :
    • Infection urinaire simple de la femme :
      • 1ère intention : fosfomycine trométamol (traitement minute)
      • 2ème intention : pivmécillinam (5 jours)
    • Cystite à risque de complications de la femme :
      • Avec ECBU : amoxicilline (1ère intention), pivmécillinam (2ème intention)
      • Sans ECBU : nitrofurantoïne (1ère intention, fosfomycine-trométamol (2ème intention)
    • Infections urinaires masculines :
      • 1ère intention : ciprofloxacine
      • 2ème intention : cotrimoxazole
    Prophylaxie :
  • Cystites récidivantes de la femme : triméthoprime ou fosfomycine-trométamol
  • Respect des mesures d'hygiène des mains
  • Désinfection efficace des plaies