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Influenzae (virus de la grippe)
Cette fiche traite des virus de type A et B responsables des épidémies saisonnières de grippe.
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Classification :
- Famille : Orthomyxoviridae
- Genre : Influenzavirus A, B, C, D
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Structure de la particule virale :
- Taille : 80 à 120 nm, forme sphérique (majoritaire) ou allongée (jusqu’à 200 nm)
- Génome :
- ARN simple brin de polarité négative, segmenté (8 segments)
- Segments liés à la nucléoprotéine virale, elle-même liée à la polymérase virale (= ribonucléoprotéine virale)
- Code pour 17 protéines virales
- Capside hélicoïdale
- Virus enveloppé portant les glycoprotéines de surface : hémagglutinine (HA) et neuraminidase (NA)
- Hémagglutinine :
- environ 80% des glycoprotéines de surface (virus A)
- 16 sous-types (H1 à H16)
- rôles : attachement et internalisation du virus
- Neuraminidase :
- environ 20% des glycoprotéines de surface (virus A)
- 10 sous-types
- rôles : dégradation du mucus (progression de l’infection), aide à l’activation de l’hémagglutinine, libération des virions nouvellement formés
- Complexe ARN polymérase ARN-dépendante :
- Structure : composé de 3 protéines (2 basiques PB1 et PB2, 1 acide PA)
- PB1 : porte le domaine catalytique et 2 domaines de liaison (ARN viraux et ARN messagers)
- PB2 : liaison aux ARN messagers
- PA : rôles dans la réplication de la polymérase et dans l’assemblage du génome
- Pas d’activité correctrice des éventuelles mutations
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Cycle de multiplication virale :
- Cellules cibles : cellules épithéliales de la muqueuse du rhinopharynx
- 1 – Fixation du virus sur la cellule cible par interaction entre l’hémagglutinine virale et les acides sialiques de l’hôte
- 2 – Internalisation du virus par endocytose puis fusion de la membrane virale avec la membrane endosomale
- 3 – Libération des ribonucléoprotéines virales vers le noyau
- 4 – Transcription des ARN viraux en ARN messagers
- 4'– Réplication de l’ARN viral via la synthèse d’un ARN complémentaire de polarité positive
- 5 – Traduction des ARNm en protéines dans le cytoplasme (protéines du complexe ARN polymérase ARN-dépendante, protéines non structurales) ou dans le réticulum endoplasmique (neuraminidase, hémagglutinine)
- 6 – Modifications post-traductionnelles des protéines
- 7 – Transport des protéines vers la membrane cellulaire via l’appareil de Golgi
- 7’ – Transport des nouveaux ARN viraux vers la membrane cellulaire
- 8 – Assemblage des nouveaux virions au niveau de la membrane cytoplasmique
- 9 – Bourgeonnement des virions et libération de la cellule par l’activité sialidasique de la neuraminidase
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Épidémiologie :
- 3 types :
- A, B : responsables d’épidémies saisonnières hivernales de 6 à 12 semaines (pays tempérés), toute l’année dans les zones intertropicales (saison humide ++) ; circulation d’un seul sous-type de virus ou cocirculation de 2 à 3 virus
- C : responsables d’infections sporadiques
- Grande variabilité génétique : fort pouvoir mutagène
- Dérive antigénique (drift) : modifications (majeures ou mineures) au niveau des acides aminés des sites antigéniques d’au moins 1 glycoprotéine de surface (hémagglutinine et/ou neuraminidase)
- Cassure antigénique (shift) : changement du sous-type de l’hémagglutinine ou de la neuraminidase lors de la coinfection d’une cellule par deux virus Influenzae A différents (échange de segments d’ARN génomiques : phénomène de réassortiment génétique)
- Transmission :
- Interhumaine aérienne via les gouttelettes de Pflügge
- Manuportée (virus infectieux plusieurs jours sur surfaces inertes)
- Zoonose : type A uniquement, rarement observée (mammifères, volailles domestiques, oiseaux sauvages aquatiques)
- Au niveau mondial (chiffres OMS) :
- Environ 1 milliard de cas par an dont environ 4 millions de cas graves
- La grippe est responsable d’environ 450 000 décès par an liés à des troubles respiratoires
- En France (chiffres Santé Publique France) :
- 2 à 6 millions de personnes infectées chaque année
- Environ 10 000 décès par an
- Individus à risque d’infection :
- Affections chroniques (respiratoires, cardiaques, hépatiques, métaboliques, neurologiques)
- Obésité morbide
- Immunodépression
- Femmes enceintes
- Personnes âgées de plus de 65 ans
- Surveillance de l’épidémiologie nationale par tous les acteurs du système de santé (Insee, Centres Nationaux de Référence, réseau Sentinelles, SOS médecin, grippenet.fr)
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Pouvoir pathogène :
- Contagiosité : de 5 à 8 jours à partir de l’apparition des symptômes, 24h avant l’apparition des symptômes
- Infection des voies aériennes supérieures : rhinopharyngite polymorphe de début brutal
- Symptômes systémiques : hyperthermie, céphalées, myalgies, altération de l’état général
- Symptômes respiratoires : toux, pharyngite, dyspnée
- V-grippal : réascension de la fièvre entre le 2e et le 3e jour d’évolution
- Formes asymptomatiques : 30% des personnes infectées
- Complications :
- Infection des voies aériennes inférieures : pneumonie virale, grippe maligne avec syndrome de détresse respiratoire aiguë (SDRA)
- Surinfections bactériennes (pneumocoque +++)
- Décompensation d’une pathologie sous-jacente (pathologie cardiaque, respiratoire chronique)
- Manifestations neurologiques : convulsions, encéphalopathies, syndrome de Guillain-Barré
- Syndrome de Reye : en cas de prise concomitante d’acide acétylsalicylique
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Prélèvement :
- Écouvillon nasopharyngé
- Aspiration nasopharyngée
- Crachat profond
- Aspiration trachéo-bronchique
- Lavage broncho-alvéolaire (LBA)
- Idéalement réalisé dans les 48 premières heures après apparition des symptômes (maximum 7 jours)
- Test rapide d’orientation diagnostiques (TROD) : recherche qualitative des antigènes viraux par tests immunoenzymatiques ou immunochromatographiques, moins sensibles que les méthodes moléculaires
- Détection du génome viral par RT-PCR simplex ou multiplex
- Culture virale (laboratoires spécialisés) : caractérisation antigénique complète des virus
- Évaluation de la sensibilité aux antiviraux (laboratoires spécialisés)
- Séquençage (laboratoires spécialisés) : séquences de l’hémagglutinine et de la neuraminidase
- Sérologie réalisée par les laboratoires spécialisés
- Pas d’indication en routine, utile pour des études épidémiologiques
Diagnostic direct :
Diagnostic indirect : sérologie
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Éléments de traitement :
- Formes bénignes :
- Repos
- Traitement symptomatique : prise d’antalgique, hydratation
- Contre-indication formelle : prise d’acide acétylsalicylique (risque de syndrome de Reye)
- Formes graves :
- Molécules disponibles : oseltamivir (1ère intention), zanamivir
- Durée du traitement : 5 jours
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Prophylaxie :
- Mesures d’hygiène
- Mesures barrières
- Vaccination annuelle préventive recommandée pour :
- Les sujets à risque d’infection grave
- Les personnes séjournant dans un établissement médico-social d’hébergement ou de soins de suite
- L’entourage des nourrissons < 6 mois nés prématurément ou présentant une pathologie pulmonaire, neurologique ou neuromusculaire
- L’entourage des patients immunodéprimés
- 4 vaccins disponibles sur le marché : 1 à 2 doses recommandée(s) selon le vaccin
- Isolement de type « air » des patients infectés
Mise à jour : mai 2024