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Influenzae (virus de la grippe)

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Cette fiche traite des virus de type A et B responsables des épidémies saisonnières de grippe.

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Classification
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Structure de la particule virale
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Cycle de multiplication virale
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Épidémiologie
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Pouvoir pathogène
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Diagnostic biologique
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Éléments de traitement
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Prophylaxie
    Classification :
  • Famille : Orthomyxoviridae
  • Genre : Influenzavirus A, B, C, D
    Structure de la particule virale :
  • Taille : 80 à 120 nm, forme sphérique (majoritaire) ou allongée (jusqu’à 200 nm)
  • Génome :
    • ARN simple brin de polarité négative, segmenté (8 segments)
    • Segments liés à la nucléoprotéine virale, elle-même liée à la polymérase virale (= ribonucléoprotéine virale)
    • Code pour 17 protéines virales
  • Capside hélicoïdale
  • Virus enveloppé portant les glycoprotéines de surface : hémagglutinine (HA) et neuraminidase (NA)
    • Hémagglutinine :
      • environ 80% des glycoprotéines de surface (virus A)
      • 16 sous-types (H1 à H16)
      • rôles : attachement et internalisation du virus
    • Neuraminidase :
      • environ 20% des glycoprotéines de surface (virus A)
      • 10 sous-types
      • rôles : dégradation du mucus (progression de l’infection), aide à l’activation de l’hémagglutinine, libération des virions nouvellement formés
  • Complexe ARN polymérase ARN-dépendante :
    • Structure : composé de 3 protéines (2 basiques PB1 et PB2, 1 acide PA)
    • PB1 : porte le domaine catalytique et 2 domaines de liaison (ARN viraux et ARN messagers)
    • PB2 : liaison aux ARN messagers
    • PA : rôles dans la réplication de la polymérase et dans l’assemblage du génome
    • Pas d’activité correctrice des éventuelles mutations
    Cycle de multiplication virale :
  • Cellules cibles : cellules épithéliales de la muqueuse du rhinopharynx

  • 1 – Fixation du virus sur la cellule cible par interaction entre l’hémagglutinine virale et les acides sialiques de l’hôte
  • 2 – Internalisation du virus par endocytose puis fusion de la membrane virale avec la membrane endosomale
  • 3 – Libération des ribonucléoprotéines virales vers le noyau
  • 4 – Transcription des ARN viraux en ARN messagers
  • 4'– Réplication de l’ARN viral via la synthèse d’un ARN complémentaire de polarité positive
  • 5 – Traduction des ARNm en protéines dans le cytoplasme (protéines du complexe ARN polymérase ARN-dépendante, protéines non structurales) ou dans le réticulum endoplasmique (neuraminidase, hémagglutinine)
  • 6 – Modifications post-traductionnelles des protéines
  • 7 – Transport des protéines vers la membrane cellulaire via l’appareil de Golgi
  • 7’ – Transport des nouveaux ARN viraux vers la membrane cellulaire
  • 8 – Assemblage des nouveaux virions au niveau de la membrane cytoplasmique
  • 9 – Bourgeonnement des virions et libération de la cellule par l’activité sialidasique de la neuraminidase
    Épidémiologie :
  • 3 types :
    • A, B : responsables d’épidémies saisonnières hivernales de 6 à 12 semaines (pays tempérés), toute l’année dans les zones intertropicales (saison humide ++) ; circulation d’un seul sous-type de virus ou cocirculation de 2 à 3 virus
    • C : responsables d’infections sporadiques

  • Grande variabilité génétique : fort pouvoir mutagène
    • Dérive antigénique (drift) : modifications (majeures ou mineures) au niveau des acides aminés des sites antigéniques d’au moins 1 glycoprotéine de surface (hémagglutinine et/ou neuraminidase)
    • Cassure antigénique (shift) : changement du sous-type de l’hémagglutinine ou de la neuraminidase lors de la coinfection d’une cellule par deux virus Influenzae A différents (échange de segments d’ARN génomiques : phénomène de réassortiment génétique)

  • Transmission :
    • Interhumaine aérienne via les gouttelettes de Pflügge
    • Manuportée (virus infectieux plusieurs jours sur surfaces inertes)
    • Zoonose : type A uniquement, rarement observée (mammifères, volailles domestiques, oiseaux sauvages aquatiques)

  • Au niveau mondial (chiffres OMS) :
    • Environ 1 milliard de cas par an dont environ 4 millions de cas graves
    • La grippe est responsable d’environ 450 000 décès par an liés à des troubles respiratoires

  • En France (chiffres Santé Publique France) :
    • 2 à 6 millions de personnes infectées chaque année
    • Environ 10 000 décès par an

  • Individus à risque d’infection :
    • Affections chroniques (respiratoires, cardiaques, hépatiques, métaboliques, neurologiques)
    • Obésité morbide
    • Immunodépression
    • Femmes enceintes
    • Personnes âgées de plus de 65 ans

  • Surveillance de l’épidémiologie nationale par tous les acteurs du système de santé (Insee, Centres Nationaux de Référence, réseau Sentinelles, SOS médecin, grippenet.fr)
    Pouvoir pathogène :
  • Contagiosité : de 5 à 8 jours à partir de l’apparition des symptômes, 24h avant l’apparition des symptômes

  • Infection des voies aériennes supérieures : rhinopharyngite polymorphe de début brutal
    • Symptômes systémiques : hyperthermie, céphalées, myalgies, altération de l’état général
    • Symptômes respiratoires : toux, pharyngite, dyspnée
    • V-grippal : réascension de la fièvre entre le 2e et le 3e jour d’évolution

  • Formes asymptomatiques : 30% des personnes infectées

  • Complications :
    • Infection des voies aériennes inférieures : pneumonie virale, grippe maligne avec syndrome de détresse respiratoire aiguë (SDRA)
    • Surinfections bactériennes (pneumocoque +++)
    • Décompensation d’une pathologie sous-jacente (pathologie cardiaque, respiratoire chronique)
    • Manifestations neurologiques : convulsions, encéphalopathies, syndrome de Guillain-Barré
    • Syndrome de Reye : en cas de prise concomitante d’acide acétylsalicylique
    Prélèvement :
  • Écouvillon nasopharyngé
  • Aspiration nasopharyngée
  • Crachat profond
  • Aspiration trachéo-bronchique
  • Lavage broncho-alvéolaire (LBA)

    • Diagnostic direct :
  • Idéalement réalisé dans les 48 premières heures après apparition des symptômes (maximum 7 jours)
  • Test rapide d’orientation diagnostiques (TROD) : recherche qualitative des antigènes viraux par tests immunoenzymatiques ou immunochromatographiques, moins sensibles que les méthodes moléculaires
  • Détection du génome viral par RT-PCR simplex ou multiplex
  • Culture virale (laboratoires spécialisés) : caractérisation antigénique complète des virus
  • Évaluation de la sensibilité aux antiviraux (laboratoires spécialisés)
  • Séquençage (laboratoires spécialisés) : séquences de l’hémagglutinine et de la neuraminidase

    • Diagnostic indirect : sérologie
  • Sérologie réalisée par les laboratoires spécialisés
  • Pas d’indication en routine, utile pour des études épidémiologiques
    Éléments de traitement :
  • Formes bénignes :
    • Repos
    • Traitement symptomatique : prise d’antalgique, hydratation
    • Contre-indication formelle : prise d’acide acétylsalicylique (risque de syndrome de Reye)

  • Formes graves :
    • Molécules disponibles : oseltamivir (1ère intention), zanamivir
    • Durée du traitement : 5 jours
    Prophylaxie :
  • Mesures d’hygiène

  • Mesures barrières

  • Vaccination annuelle préventive recommandée pour :
    • Les sujets à risque d’infection grave
    • Les personnes séjournant dans un établissement médico-social d’hébergement ou de soins de suite
    • L’entourage des nourrissons < 6 mois nés prématurément ou présentant une pathologie pulmonaire, neurologique ou neuromusculaire
    • L’entourage des patients immunodéprimés
    • 4 vaccins disponibles sur le marché : 1 à 2 doses recommandée(s) selon le vaccin

  • Isolement de type « air » des patients infectés

Mise à jour : mai 2024