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Mycobacterium abscessus
Espèces du complexe :
- Mycobacterium abscessus sensu stricto
- Mycobacterium massilliense
- Mycobacterium bolletti
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Classification :
- Actinobacteria
- Actinobacteria
- Corynebacteriales
- Mycobacteriaceae
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Examen direct :
- Après coloration spécifique (Ziehl-Neelsen, auramine = coloration fluorescente)
- Bacilles acido-alcoolorésistants (BAAR)
- État frais : immobilité
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Culture :
- Morphologie :
- Colonies lisses ou rugueuses, blanches
- Formation possible en cordes en microscopie
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Habitat naturel :
- Environnement (eaux, sol)
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Facteurs de virulence :
- Formation de biofilms
- Résistance dans l’environnement, à de fortes et faibles températures
-
Épidémiologie :
- Bactéries opportunistes
- Transmission :
- Par voie cutanée
- Par voie respiratoire
- Transmission interhumaine (hypothèse récente)
- Facteurs de risque d'infection pulmonaire :
- Pathologie pulmonaire préexistante (mucoviscidose +++)
- Personne âgée
- Facteurs de risque d'infections cutanéomuqueuses :
- Acupuncture
- Tatouages
- Injections sous-cutanées
- Vaccination
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Pathogénicité :
- Infections cutanéomuqueuses :
- Lésions granulomateuses
- Complications : ulcération, cellulite, diffusion cutanée
- Infections pulmonaires :
- Patient non VIH : même tableau clinique que la tuberculose maladie (progression lente)
- Patients VIH au stade SIDA : progression très rapide (toux, hyperthermie, perte de poids)
- Critères d’infections pulmonaires à mycobactéries atypiques :
- Symptomatologie évocatrice
- Critères radiologiques
- Au moins 2 prélèvements respiratoires rapprochés positifs et/ou une biopsie positive
- Infections ostéoarticulaires :
- Spondylodiscites, ostéomyélites…
- Post-traumatiques ou post-chirurgicales
- Mauvais pronostic fonctionnel
- Infections disséminées :
- Sur terrain fragile (immunodépression +++)
- Principaux organes touchés : appareil digestif, appareil respiratoire
- Progression rapide vers le décès
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Il doit être réalisé dans un laboratoire de sécurité microbiologique de niveau 3
- Infection pulmonaire : 1 prélèvement le matin si possible, 3 jours d’affilée
- Tubage gastrique
- Prélèvements respiratoires : expectorations, aspirations bronchiques, lavages broncho-alvéolaires
- Infection extrapulmonaire :
- Liquides de ponction
- Liquide céphalorachidien
- Urines (sur 3 jours)
- Suppurations diverses
- Sang pour hémocultures (flacons spécifiques)
- Selles
- Échantillons : prélèvements respiratoires, selles
- But : minimiser la contamination du prélèvement par la flore commensale
- Réactifs à base de soude
Prélèvement :
Décontamination de l'échantillon :
Réalisation de l'examen direct (après centrifugation de l’échantillon)
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Mise en culture :
- Mycobactéries à croissance rapide < 7 jours (Rapid Growing Mycobacteria)
- Respiration : aérobie stricte
- Milieux sélectifs :
- Solides : milieu de Lowenstein-Jensen, milieu Coletsos
- Liquides en flacons d’hémocultures (45 jours d’incubation minimum)
- Incubation : 30°C, 37°C et 42°C pendant 8 semaines
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Identification :
- PCR : identification d’espèce
- Séquençage de l’ARN 16S
- MALDI-TOF couplé à la spectrométrie de masse (en développement)
- Antibiogramme réalisé par un laboratoire spécialisé.
- Résistance inductible aux macrolides
- Résistance naturelle aux antituberculeux classiques (éthambutol, rifampicine, isoniazide, pyrazinamide)
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Traitement curatif :
- Peu efficace
- Traitement antibiotique adapté : clarithromycine, amikacine, céfoxitine, imipénème, azithromycine, linézolide, tigécycline
- Durée du traitement antibiotique variable (minimum 2 mois)
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Prophylaxie :
- Contrôle de l'immunodépression et des pathologies sous-jacentes
- Respect des bonnes pratiques d'hygiène hospitalière