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Mycobacterium tuberculosis
= Bacille de Koch.
Espèces du complexe :
- Mycobacterium tuberculosis
- Mycobacterium bovis
- Mycobacterium africanum
- Mycobacterium caprae
- Mycobacterium microti
- Mycobacterium canettii
- Mycobacterium pinnipedii
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Classification :
- Actinobacteria
- Actinobacteria
- Corynebacteriales
- Mycobacteriaceae
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Examen direct :
- Après coloration spécifique (Ziehl-Neelsen, auramine = coloration fluorescente)
- Bacilles acido-alcoolorésistants (BAAR)
- État frais : immobilité
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Culture :
- Morphologie :
- M. tuberculosis (2 à 3 semaines de culture) : colonies jaunes lisses puis rugueuses en chou-fleur, formation de cordes en microscopie
- M. bovis (4 à 6 semaines de culture) : colonies plates, blanches et brillantes
- M. africanum (4 à 6 semaines de culture) : petites colonies rondes granuleuses de couleur crème
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Habitat naturel :
- Réservoir humain : 1/3 de la population mondiale infectée de tuberculose latente
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Facteurs de virulence :
- Pas de sécrétion de toxines
- Résistance à la dégradation par les macrophages alvéolaires
- Multiplication dans les macrophages alvéolaires
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Épidémiologie :
- Maladie à déclaration obligatoire
- 10,4 millions de personnes atteintes de tuberculose maladie dans le Monde
- Transmission : interhumaine respiratoire
- Maladie endémique dans les pays en voie de développement (Afrique, Asie du Sud-Est, Europe de l’Est)
- Facteurs de risque d'infection :
- Immunodépression
- Faible niveau socio-économique
- Infection par le VIH
-
Pathogénicité :
- Agents de la tuberculose.
- Tuberculose maladie :
- Tuberculose pulmonaire : toux persistante + hyperthermie nocturne + altération de l’état général
- Formes extrapulmonaires :
- Tuberculose ganglionnaire ou lymphatique (ganglions cervicaux, ganglions supraclaviculaires)
- Tuberculose pleurale
- Tuberculose péricardique
- Méningite tuberculeuse
- Tuberculose disséminée
- Tuberculose ostéoarticulaire
- Tuberculose génito-urinaire
- Tuberculose gastro-intestinale
- Tuberculose cutanée (très rare)
- Tuberculose latente
-
Il doit être réalisé dans un laboratoire de sécurité microbiologique de niveau 3
- Infection pulmonaire : 1 prélèvement le matin si possible, 3 jours d’affilée
- Tubage gastrique
- Prélèvements respiratoires : expectorations, aspirations bronchiques, lavages broncho-alvéolaires
- Infection extrapulmonaire :
- Liquides de ponction
- Liquide céphalorachidien
- Urines (sur 3 jours)
- Suppurations diverses
- Sang pour hémocultures (flacons spécifiques)
- Selles
- Échantillons : prélèvements respiratoires, selles
- But : minimiser la contamination du prélèvement par la flore commensale
- Réactifs à base de soude
Prélèvement :
Décontamination de l'échantillon :
Réalisation de l'examen direct (après centrifugation de l’échantillon)
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Mise en culture :
- Mycobactéries à croissance lente > 7 jours (Slow Growing Mycobacteria)
- Respiration : aérobie stricte
- Milieux sélectifs :
- Solides : milieu de Lowenstein-Jensen, milieu Coletsos
- Liquides en flacons d’hémocultures (45 jours d’incubation minimum)
- Incubation : 30°C, 37°C et 42°C pendant 8 semaines
-
Identification :
- Caractéristiques antigéniques :
- Tests rapides d’identification : détection de l’antigène MPT64 (immunochromatographie)
- PCR :
- Recherche du bacille tuberculeux et de la résistance aux antibiotiques
- Doit être effectuée en parallèle de la culture
- Sur prélèvement initial ou sur les colonies en culture
- Séquençage de l’ARN 16S
- MALDI-TOF couplé à la spectrométrie de masse (en développement)
- Antibiogramme réalisé par un laboratoire spécialisé.
- Souches multirésistantes émergentes :
- MDR-TB : résistance à la rifampicine et l’isoniazide
- XDR-TB : résistance à la rifampicine, l’isoniazide, les fluoroquinolones et les molécules de seconde ligne de traitement (kanamycine, amikacine, capréomycine)
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Traitement curatif :
- Souches multisensibles :
- Durée = 6 mois
- 1ère phase (2 mois) : association de rifampicine + isoniazide + éthambutol + pyrazinamide
- 2ème phase (4 mois) : association de rifampicine + isoniazide
- Souches multirésistantes :
- Traitement d’attaque (durée = 8 mois) : au moins 4 antibiotiques (pyrazinamide, fluoroquinolone, aminoside, éthionamide, cyclosérine ou acide para-aminosalicylique PAS)
- Traitement d’entretien (durée totale = 18 mois)
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Prophylaxie :
- Détection précoce de la résistance d’une souche à la rifampicine
- Bonne observance des patients traités
- Isolement respiratoire de patients malades
- Dépistage des patients contact
- Vaccination :
- Par le vaccin BCG
- 1 dose vaccinale par voie intradermique
- Fortement recommandée pour les enfants à risque de tuberculose
- Plus d’obligation de vaccination pour les professionnels de santé depuis le 1er mars 2019