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Salmonella enterica
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Classification :
- Proteobacteria
- Gammaproteobacteria
- Enterobacteriales
- Enterobacteriaceae
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Examen direct :
- Bacilles Gram négatif
- Coloration bipolaire
- Capsulés (sérotypes de fièvre typhoïde et paratyphoïde)
- État frais : mobilité (ciliature péritriche)
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Culture :
- Morphologie :
- Petites colonies convexes translucides sur milieux usuels, colorées sur milieux spécifiques
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Habitat naturel :
- Flore commensale intestinale (20% de la population)
- Hommes et animaux à sang chaud (sous-type enterica), animaux à sang froid (autres sous-types)
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Facteurs de virulence :
- Systèmes de sécrétion des toxines
- Toxines CDT (rôle inconnu)
- Gènes de virulence organisés en îlots de pathogénicité : codent pour la capsule, des adhésines, des protéines impliquées dans la survie dans les macrophages …
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Épidémiologie :
- 6 sous-espèces : enterica, salamae, arizonae, diarizonae, houtenae, indica
- Sous-espèce enterica : 1580 sérotypes dont Typhi et Typhimurium
- Srotypes strictement humains : Typhi, Paratyphi A, Sendai
- Sérotypes humains et animaux : nombreux dont Typhimurium
- Transmission par voie féco-orale
- Fièvres typhoïdes et paratyphoïdes (sérotypes Typhi, Paratyphi) :
- Endémiques en Afrique (dont Mayotte), Amérique du sud (dont Guyane), Asie (Inde +++)
- France : cas d’importation +++ ou épidémies dues à des repas contaminants
- Pic d’incidence (pays endémiques) : enfants et jeunes adolescents
- Salmonelloses non typhiques (sérotypes Typhimurium et Enteritidis) :
- Incidence en augmentation dans les pays industrialisés
- Anthropozoonose
- Fièvres typhoïdes et paratyphoïdes : maladies à déclaration obligatoire
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Pathogénicité :
- Fièvre typhoïde ou paratyphoïde (sérotypes Typhi ou Paratyphi) :
- Toute fièvre en retour d’une zone d’endémie doit faire évoquer une fièvre typhoïde
- Sévérité des symptomes dépendant de la quantité de l’inoculum
- Incubation : 7 à 14 jours
- Fièvre élevée en plateau + céphalées + anorexie + douleurs abdominales + diarrhées (« jus de melon ») ou constipation
- Signes associés : hépatomégalie, splénomégalie, tâches cutanées, obnubilation
- Complications : hémorragies digestives, cholécystites, myocardites, encéphalites, ostéomyélites, glomérulonéphrites
- Gastroentérites (TIAC) :
- 12 à 24h après le repas contaminant
- Diarrhée fébrile
- Durée : quelques jours
- Guérison spontanée
- Complications : déshydratation, perforation et hémorragies digestives
- Infections extradigestives :
- Infections pulmonaires
- Infections ostéoarticulaires
- Méningites
- Bactériémies
- Abcès de localisations diverses
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Prélèvement :
- Prélèvements respiratoires
- Sang pour hémocultures
- Liquides de ponction
- Suppurations diverses
- Liquide céphalorachidien
- Urines
- Selles
Réalisation de l'examen direct
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Mise en culture :
- Bactéries non exigeantes
- Respiration : aéro-anaérobie facultative
- Milieux : milieux usuels, milieux sélectifs (gélose SS, gélose Hektoen, gélose XLD)
- Incubation : 37°C, air ambiant
- Coproculture négative la première semaine de l’infection mais pouvant rester positive longtemps après la fin des symptômes
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Identification :
- Caractéristiques antigéniques :
- Sérotypage de la souche : indispensable
- Technique d'agglutination sur lame
- Typage de l’antigène somatique O
- Typage de l’antigène flagellaire H
- Caractéristiques biochimiques d'orientation :
- Catalase positive
- Oxydase négative
- MALDI-TOF couplé à la spectrométrie de masse (identification de l’espèce uniquement)
- Galeries d'identification bactérienne
- Nombreuses techniques de biologie moléculaires développées pour le « sérotypage moléculaire » (centres spécialisés)
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Résistances naturelles :
- Groupe 0 des Entérobactéries : pas de production de β-lactamase, sensibilité naturelle à tous les antibiotiques
- Résistance acquise possible à tous les antibiotiques : incidence des souches résistantes en augmentation
- β-lactamases acquises : pénicillinases, β-lactamases à spectre étendu, céphalosporinases
- Ciprofloxacine (exceptionnellement)
Résistances acquises :
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Traitement curatif :
- Fièvre typhoïde et paratyphoïde :
- Pays industrialisés : ciprofloxacine en première intention (salmonelloses sévères), ceftriaxone ou azithromycine en 2ème intention
- Pays en voie de développement : chloramphénicol, ampicilline, cotrimoxazole
- Salmonelloses non typhiques :
- Antibiothérapie non recommandée dans les formes classiques
- Formes graves ou patient immunodéprimé : ciprofloxacine, ampicilline, cotrimoxazole, chloramphénicol
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Prophylaxie :
- Lutte contre le péril fécal
- Surveillance épidémiologique : enquête sur les épidémies pour éviter la propagation de l’infection
- Dépistage et traitement par ampicilline des porteurs sains
- Vaccination :
- Vaccination obligatoire en France pour les personnels de laboratoires de biologie médicale manipulant les selles (injection puis rappel tous les 3 ans)
- Vaccin oral disponible dans les zones d’endémie
- Isolement des patients hospitalisés et respect des mesures d'hygiène hospitalière
- Prophylaxie alimentaire :
- Contrôle bactériologique des eaux de boissons et des aliments
- Conservation des œufs et des produits à base d’œufs au réfrigérateur
- Consommation rapide des œufs et produits à base d’œufs
- Patients immunodéprimés à risque élevé : antibioprophylaxie par cotrimoxazole