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Shigella sp.
4 espèces du genre Shigella :
- Shigella dysenteriae
- Shigella flexneri
- Shigella boydii
- Shigella sonnei
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Classification :
- Embranchement : Pseudomonadota
- Classe : Gammaproteobacteria
- Ordre : Enterobacterales
- Famille : Enterobacteriaceae
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Examen direct :
- Bacilles Gram négatif
- Coloration bipolaire
- État frais : mobilité (ciliature péritriche)
- Dans les selles : nombreux polynucléaires neutrophiles avec déséquilibre de la flore fécale
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Culture :
- Morphologie :
- Colonies de taille moyenne, rondes et lisses à bords réguliers
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Habitat naturel :
- Bactéries n’appartenant pas à une flore commensale de l’homme ou des animaux
- Survie faible dans le milieu extérieur
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Facteurs de virulence :
- Production d'entérotoxines 1 et 2 (Stx1, Stx2) ou shigatoxines
- Capacité d’envahissement des épithéliums coliques et rectaux
- Induction de l’apoptose des cellules infectées
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Épidémiologie :
- Pathogène strictement humain
- Dose minimale infestante : faible
- Transmission :
- Voie oro-fécale (manuportage, ingestion d’eau ou d’aliments souillés)
- Rarement : indirecte via vecteurs contaminés (eaux, aliments)
- Rarement : voie sexuelle
- Responsable d'épidémies (enfants en collectivité, cas familiaux)
- Pics épidémiques en été et en automne (pays européens)
- Distribution géographique des infections par espèces :
- Pays en développement : Shigella flexneri et Shigella dysenteriae sont prédominantes
- Pays dits développés : Shigella sonnei est prédominante
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Pathogénicité :
- Incubation : 1 à 3 jours
- Infection généralement symptomatique chez l'enfant et asymptomatique chez l'adulte
- Début brutal
- Rectocolite inflammatoire aiguë fébrile
- Diarrhée cholériforme modérée (avec présence de mucus dans les selles) associée à des douleurs abdominales intenses
- Évolution possible vers un syndrome dysentérique ou dysenterie bacillaire (diarrhées glairo-sanglantes + crampes intestinales + hyperthermie sévère)
- Complications :
- Digestives : prolapsus rectaux, péritonites …
- Extra-digestives : bactériémies, convulsions, syndrome hémolytique et urémique
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Prélèvement :
- Selles
- Écouvillonnage rectal (uniquement jeunes enfants, prélèvement à visée épidémiologique)
- Liquides de ponction
- Sang pour hémocultures
Réalisation de l'examen direct
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Mise en culture :
- Bactéries non exigeantes
- Respiration : aéro-anaérobie facultative
- Milieux : milieux chromogènes (gélose SS, gélose Hektoen, gélose XLD)
- Incubation : 37°C, air enrichi en CO2
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Identification :
- Caractéristiques antigéniques :
- Test d’agglutination directe sur lame : identification de l’espèce de Shigella
- Technique immunoenzymatique : recherche de la shigatoxine
- Caractéristiques biochimiques d'orientation :
- Catalase positive (sauf Shigella dysenteriae de sérotype 1)
- Oxydase négative
- Lactose négative
- H2S négative
- MALDI-TOF couplé à la spectrométrie de masse (attention, confusion avec Escherichia coli)
- Galeries d'identification bactérienne
- PCR (identification, recherche des toxines)
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Résistances naturelles :
- Groupe 0 des Entérobactéries : pas de production de β-lactamase
- Sensibilité naturelle à tous les antibiotiques efficaces sur les bactéries Gram négatif
- Sulfamides
- Streptomycine
- Amoxicilline
- Cotrimoxazole
- Acquisition possible d'une résistance à toutes les molécules utilisables pour le traitement (souches XDR)
Résistances acquises :
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Traitement curatif :
- Traitement symptomatique (suffisant dans la plupart des cas)
- Formes graves : β-lactamine, cotrimoxazole, fluoroquinolone (selon l’antibiogramme), azithromycine, pendant 3 à 5 jours
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Prophylaxie :
- Lutte contre le péril fécal
- Respect des mesures d'hygiène des mains
- Éviction scolaire conseillée en cas de gastro-entérite aiiguë
- Vaccination en cours de développement
Mise à jour : août 2024