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Streptococcus pneumoniae
Appartient au groupe mitis.
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Classification :
- Firmicutes
- Bacilli
- Lactobacillales
- Streptococcaceae
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Examen direct :
- Cocci Gram positif capsulés, non sporulés, parfois intracellulaires (dans les polynucléaires neutrophiles)
- Disposition : diplocoques lancéolés en flamme de bougie ou courtes chainettes
- Aspect parfois atypique
- État frais : immobilité
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Culture :
- Morphologie :
- Petites colonies bombées grisâtres ou opaques à bord régulier, α-hémolytiques
- Aspect en anneau déprimé au centre des colonies (sous l’action des autolysines)
- Colonies parfois muqueuses (selon le sérotype)
- β-hémolyse possible après incubation en anaérobiose
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Habitat naturel :
- Flore commensale rhino-pharyngée (15 à 30% de la population, 50% des enfants)
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Facteurs de virulence :
- Capsule : résistance à la phagocytose
- Pneumolysine : cytolyse des cellules respiratoires et endothéliales + effet pro-inflammatoire
- Autolysine : libération de la pneumolysine
- Protéines de surface : adhérence aux cellules bronchiques
- Neuraminidase : diffusion méningée
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Épidémiologie :
- 1er agent de méningites en France
- 1ère cause de pneumonies communautaires documentées en France
- 2ème cause d’otite moyenne aiguë avant 2 ans (après Haemophilus influenzae)
- Infections dans un contexte particulier : hôpital, prison, foyers
- Infections graves : âges extrêmes de la vie
- Surveillance des infections invasives à pneumocoque : CNR, InVS, Observatoires régionaux des pneumocoques
- Transmission directe par voie aérienne
- Mortalité : environ 10%
- Facteurs de risque :
- Âge (nourrissons, > 65 ans)
- Tabagisme
- Viroses respiratoires saisonnières (grippe +++)
- Immunodépression
- Pathologie à risque (insuffisance respiratoire chronique, insuffisance rénale, diabète déséquilibré, insuffisance cardiaque, hépatopathie chronique, brèche ostéoméningée)
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Pathogénicité :
- Infections respiratoires hautes : otites moyennes aiguës, sinusites
- Infections respiratoires basses : pneumonie franche lobaire aiguë = pneumopathie aiguë communautaire (toux + expectoration purulente couleur rouille + douleur basithoracique)
- Conjonctivites
- Infections invasives (septicémies) avec purpura fulminans
- Méningites
- Pleurésies, abcès du poumon secondaires à une pneumonie
- Endocardites (rares)
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Prélèvement :
- Prélèvement respiratoire
- Sang pour hémocultures
- Valves cardiaques
- Liquide céphalorachidien
- Liquides de ponction
- Suppurations diverses
- Binax NOW*
- Utilisable sur le LCR ou les urines
- Détection du polyoside C par immunochromatographie
- Sensibilité = 90%
- Non valide chez les enfants
Réalisation de l'examen direct
Recherche directe des antigènes solubles : Test de Diagnostic Rapide
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Mise en culture :
- Bactéries exigeantes
- Respiration : anaérobie aérotolérant
- Culture inhibée par l’optochine : disque d’inhibition > 14 mm
- Milieux enrichis (géloses sang), milieux sélectifs
- Incubation : 37°C, air enrichi en CO2 ou en anaérobiose
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Identification :
- Caractéristiques antigéniques :
- Groupe C de Lancefield
- Sérotypage à visée épidémiologique
- Caractéristiques biochimiques d'orientation :
- Catalase négative
- Oxydase négative
- MALDI-TOF couplé à la spectrométrie de masse (peu discriminant entre espèces proches)
- Galeries d'identification bactérienne
- Séquençage de l’ARN 16S
- PCR (laboratoires spécialisés)
- Gène lytA (autolysine)
- Gène pno (pneumolysine)
- Gène capsA
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Résistances naturelles :
- Aminosides (bas niveau)
- Quinolones
- Colistine
- Mécillinam
- Aztréonam
- Absence de production de β-lactamase : résistance à la pénicilline par une modification des PLP (pneumocoque de sensibilité diminuée à la pénicilline – PSDP)
- Évaluation via le disque d’oxacilline
- Si le diamètre est sensible, la souche est sensible à toutes les β-lactamines
- Si le diamètre est résistant, déterminer la CMI des β-lactamines utilisées en clinique
- PSDP : environ 20% des souches
- Résistance aux macrolides (MLSB inductible ou efflux) : environ 25% des souches
Résistances acquises :
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Traitement curatif :
- Pneumonie : amoxicilline (PSDP : céfotaxime, ceftriaxone ou pristinamycine)
- Méningite : amoxicilline ou céfotaxime ou ceftriaxone (PSDP : vancomycine)
- Otite moyenne aiguë : amoxicilline (PSDP : céfuroxime, cefpodoxime ou pristinamycine)
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Prophylaxie :
- Isolement respiratoire des patients atteints de pneumonie
- Vaccination obligatoire :
- Obligatoire chez l’enfant depuis janvier 2018
- Deux types de vaccins :
- VPC13 (vaccin pneumococcique conjugué 13-valent)
- VPP23 (vaccin pneumococcique non conjugué 23-valent)
- < 2 ans : 1 dose de VPC13 à 2 mois, 4 mois et 11 mois (+ 1 dose à 3 mois si prématurité ou enfant à risque d’infection invasive)
- Enfant de 2 à 5 ans à risque :
- Vaccination antérieure : 1 dose de VPP23
- Non vacciné : 1 dose de VPC13 à S0 + S8, VPP23 à S16
- > 5 ans et adulte à risque :
- Non vacciné : 1 dose de VPC13 puis 1 dose de VPP23 au moins 8 semaines plus tard
- Vaccination antérieure :
- Avec VPC13 et VPP23 : 1 dose de VPP23 au minimum 5 ans après la dernière dose
- Avec VPP23 seul : 1 dose de VPC13 au minimum 1 an après la dernière dose
- Respect des mesures d'hygiène des mains
- Respect des bonnes pratiques d'hygiène hospitalière